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蛋白质组学研究需要了解的UniProt数据库的实用小功能
- 分类 ：腾博会官网视角
- 作者 ：腾博会官网生物
- 来源 ：
【概要描述】Uniprot数据库是目前蛋白质研究领域信息最为全面 ，资源最为广泛的数据库 ，能够给从事蛋白研究的人员提供有力支持 。
蛋白质组学研究需要了解的UniProt数据库的实用小功能
【概要描述】Uniprot数据库是目前蛋白质研究领域信息最为全面 ，资源最为广泛的数据库 ，能够给从事蛋白研究的人员提供有力支持 。
- 分类 ：腾博会官网视角
- 作者 ：腾博会官网生物
- 来源 ：
- 发布时间 ：2022-05-20 14:38
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Uniprot数据库是目前蛋白质研究领域信息最为全面 ，资源最为广泛的数据库 ，能够给从事蛋白研究的人员提供有力支持 。最近Uniprot数据库官方网站进行了全新的改版和升级
网站地址 ：http://beta.uniprot.org/
（目前还是beta版本 ，预计2022年正式上线）
但是很多老师和科研工作者对这个数据库还不是特别熟悉 ，由此 ，腾博会官网生物以新网站为例 ，介绍几个非常实用的小功能 ，教你玩转Uniport蛋白信息数据库 。
| 简要搜索
在数据中直接搜索疾病名称 ，蛋白类别或者功能描述可以快速找到自己感兴趣的蛋白信息 。如我们这地方搜索“细胞凋亡（apoptosis）”后就会出现大量相关研究的蛋白信息 ，然后可以点击左侧的选项卡片进一步筛选自己喜欢的蛋白 。
| ID转换
我们知道基因有各种各样的ID ，很多时候我们需要进行不同的数据比对时候发现ID不一致 ，这个时候我们的Uniprot网站上的这个功能就能够派上用场了 ，打开网站后就可以看到ID mapping 。
将自己需要进行转化的ID粘贴到输入框中 ，或者点击load from a text file将ID文件导入进来 ，然后选择下方的From database 和To database中对应的ID类型 ，如果要更严格的筛选的话可以输入物种名称或者对应的物种ID缩小范围 ，最后点击Map IDs等待数据库对ID进行匹配转化 ，等待数据库进行匹配就可以了 。
匹配完成之后 ，我们就可以看到最终的匹配结果了 ，同样可以点击左边的选项卡片进一步筛选 。点击上面的Download按钮可以将本次mapping的结果下载下来 。
| Peptide search
Peptide search简言之就是通过输入一段氨基酸序列 ，在数据库中搜索其可能存在那些的那白中 。在输入框中粘贴氨基酸序列或者导入包含序列的文件（注 ：单个序列至少包含2个氨基酸 ，一次最高可以输入100个序列信息）
输入序列之后 ，下面可以进行其他参数的设置 ，如选定物种范围 ，是否只搜索reviewed范围 ，是否区分亮氨酸和异亮氨酸等等 。
待数据库对输入的序列进行比对完成之后就可以看到匹配结果了 ，这地方我们可以看到以NWGLSVYADKPETTKEQLGEFYEALDCLR为例 ，匹配人的数据库发现有两个蛋白中存在这个氨基酸序列 。
Uniprot数据库为从事蛋白研究提供了非常多的便利 。同时Uniprot网站也在不断的升级更新 ，以为我们提供更好的体验 。
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